Die JUSO Schweiz ist in Sektionen organisiert. Die Sektionen sind unabhängig von der JUSO Schweiz. Während sich die JUSO Schweiz mit der nationalen Politik beschäftigt, kümmern sich die Sektionen um die politische Arbeit in den Kantonen, Städten und Dörfern. In einigen Kantonen gibt es mehrere Sektionen, die gemeinsam in einer Kantonalpartei organisiert sind.
Die JUSO Schweiz hat diese Sektionen: